Projekty,
publikace
Udělené granty
Zvyšování kvality studijních programů oboru Inženýrství pevných látek
SGS16/246/OHK4/3T/14 - Strukturní studie biotechnologických enzymů
Publikace
J. Zahradník, P. Kolenko et al.. (2018). The crystal structure of XdpB, the bacterial Old Yellow Enzyme, in an FMN-free form. PLoS ONE, accepted.
M. Trundová, T. Kovaľ, R.J. Owens, K. Fejfarová, J. Dušková, P. Kolenko, J. Dohnálek. (2018). Highly stable single-strand-specific 3′-nuclease/nucleotidase from Legionella pneumophila. Int. J. Biol. Macromol., in press. - okrajový příspěvek.
M. Stráňava, P Man, T. Skálová, P. Kolenko, J. Bláha, V. Fojtíková, V. Martínek, J. Dohnálek, A. Lengalová, M. Rosůlek, T. Shimizu, M. Martínková. (2017). Coordination and redox state-dependent structural changes of the heme-based oxygen sensor AfGcHK associated with intraprotein signal transduction. J. Biol. Chem., 292, 20921-20935.
T. Kovaľ, L.H. Oestergaard, J. Lehmbeck, A. Noergaard, P. Lipovová, J. Dušková, T. Skálová, M. Trundová, P. Kolenko, K. Fejfarová, J. Stránský, L. Švecová, J. Hašek, J. Dohnálek. (2016). Structural and Catalytic Properties of S1 Nuclease from Aspergillus oryzae Responsible for Substrate Recognition, Cleavage, Non-Specificity , and Inhibition. PLoS ONE, 11 (12), e0168832.
P. Mikulecký, J. Zahradník, P. Kolenko, J. Černý, T. Charnavets, L. Kolářová, I. Nečasová, P.N. Pham and B. Schneider. (2016). Crystal structure of human interferon-γ receptor 2 reveals the structural basis for receptor specificity. Acta Cryst. D72, 1017-1025.
J. Stránský, T. Kovaľ, T. Podzimek, A. Týcová, P. Lipovová, J. Matoušek, P. Kolenko, K. Fejfarová, J. Dušková, T. Skálová, J. Hašek, J. Dohnálek. (2015). The structure of a mutant of tomato multifunctional nuclease TBN1 with phosphate ion bound in the active centre explains the stabilization of the conserved crystal-packing motif of molecular superhelices. Acta Cryst., F71, 1408-1415.
Publikace - bez impaktu
Obhájené práce
Doktorské práce
2018 - Ing. Jan Stránský - Optimization of Macromolecular Crystallography Tools and Structural Studies of Nucleases.
Magisterské práce
Výzkumné úkoly
2017 - Bc. Martin Malý - Řešení struktury komplexu oxidázy s ligandem.
Bakalářské práce
2016 - Martin Malý - Optimalizace parametrů zpracování difrakčních dat oxidázy z Microdochium nivale.
Týden vědy na FJFI
2017
Synchrotronem k léčivům: modeluj si sám
Od slin ke struktuře
2016
Synchrotronem k léčivům: modeluj si sám
3D atomární struktura bílkovin za 24 hodin