Grants:

Zvyšování kvality studijních programů oboru Inženýrství pevných látek
SGS16/246/OHK4/3T/14 - Structural Studies of Enzymes for Biotechnologies

Publications

J. Zahradník, P. Kolenko et al.. (2018). The crystal structure of XdpB, the bacterial Old Yellow Enzyme, in an FMN-free form. PLoS ONE, accepted.

M. Trundová, T. Kovaľ, R.J. Owens, K. Fejfarová, J. Dušková, P. Kolenko, J. Dohnálek. (2018). Highly stable single-strand-specific 3′-nuclease/nucleotidase from Legionella pneumophila. Int. J. Biol. Macromol., in press. - minimal contribution.

. Stráňava, P Man, T. Skálová, P. Kolenko, J. Bláha, V. Fojtíková, V. Martínek, J. Dohnálek, A. Lengalová, M. Rosůlek, T. Shimizu, M. Martínková. (2017). Coordination and redox state-dependent structural changes of the heme-based oxygen sensor AfGcHK associated with intraprotein signal transduction. J. Biol. Chem., 292, 20921-20935.

T. Kovaľ, L.H. Oestergaard, J. Lehmbeck, A. Noergaard, P. Lipovová, J. Dušková, T. Skálová, M. Trundová, P. Kolenko, K. Fejfarová, J. Stránský, L. Švecová, J. Hašek, J. Dohnálek. (2016). Structural and Catalytic Properties of S1 Nuclease from Aspergillus oryzae Responsible for Substrate Recognition, Cleavage, Non-Specificity , and Inhibition. PLoS ONE, 11 (12), e0168832.

P. Mikulecký, J. Zahradník, P. Kolenko, J. Černý, T. Charnavets, L. Kolářová, I. Nečasová, P.N. Pham and B. Schneider. (2016). Crystal structure of human interferon-γ receptor 2 reveals the structural basis for receptor specificity. Acta Cryst. D72, 1017-1025.

J. Stránský, T. Kovaľ, T. Podzimek, A. Týcová, P. Lipovová, J. Matoušek, P. Kolenko, K. Fejfarová, J. Dušková, T. Skálová, J. Hašek, J. Dohnálek. (2015). The structure of a mutant of tomato multifunctional nuclease TBN1 with phosphate ion bound in the active centre explains the stabilization of the conserved crystal-packing motif of molecular superhelices. Acta Cryst., F71, 1408-1415.

Publications - no impact

M. Malý, J. Dušková, LH Oestergaard, J. Stránský, L. Švecová, P. Kolenko, J. Dohnálek. (2016). Optimalizace parametrů zpracování difrakčních dat oxidázy z Microdochium nivale. Sborník příspěvků 6. studentské vědecké konference fyziky pevných látek, Sedliště 2016, pp 5-9.

J. Stránský, L. Švecová, P. Kolenko, J. Dohnálek. (2016). Analýza vlivu expozice na difrakční data a model struktury proteinu. Sborník příspěvků 6. studentské vědecké konference fyziky pevných látek, Sedliště 2016, pp 10-15.

Defended Theses

2018 - Ing. Jan Stránský - Optimization of Macromolecular Crystallography Tools and Structural Studies of Nucleases.

2017 - Martin Malý - Structure determination of oxidase:ligand complex.

2016 - Martin Malý - Optimalizace parametrů zpracování difrakčních dat oxidázy z Microdochium nivale.

Week of Science at FNSPE

2017

Synchrotronem k léčivům: modeluj si sám
Od slin ke struktuře

2016

Synchrotronem k léčivům: modeluj si sám
3D atomární struktura bílkovin za 24 hodin